第二种教育体系则是由内务部下设的教育署主导的职业教育体系，该体系以职业预校，行政学院和船员之家为主，前者以培养各类内务部需要的半技术人员为主，比如医疗员，工程员，监测员，稽核师等，但同时也会学习通识理论知识，在通过毕业考试后就可以进入到内务部的相关部门里。
而行政学院则如字面意义那般，以培养各类初级行政人员为主，其内部会有很详细的分类子学院，譬如税务，统计，资源管理等等，一般学制为6-8年不等，同样在通过毕业考试后就能进入内务部相关机构任职，开始他们那令人羡慕的公职人员生活。
内务部的教育机构通常设立在中巢和上巢，其招收方式一般都为考试，而招收的学生则统一为12-14周岁青少年，并且还得能够流利的读写高哥特语——光是这一条就卡掉了绝大多数普通家庭的孩子，更不用说参加后面那困难重重的笔试，但这也是中巢居民最趋之若鹜的教育方向，毕竟一旦进入内务部，不出意外的话这辈子应该就安稳了，所以一些家庭甚至愿意倾其所有为孩子请一个昂贵的高哥特语家教。（这些都是老莫自己瞎编的，诸君且看一乐，不要太那啥.）
而船员之家就有些特别，因为这个机构严格说不是隶属于内务部，而是由行商浪人协会牵头，隶属于海军部的一个教育机构，其主要作用就是培养舰船所需的技术人员和上层甲板海员，虽然说大部分舰船靠着虚空之子们自己的繁衍足够维持舰船的运作不需要补充船员，但高强度的战争总会产生额外损失，船可能没沉但船员却阵亡七七八八的情况屡见不鲜，另外新建造的船只也同样需要技术船员，光靠奴工和机仆是开不了一整艘战舰的，但海军又不可能在每一个行星都建立海军基地，反倒是行商浪人们因为频繁的冒险活动也大量需要船员，于是船员之家这个奇怪的机构就诞生了，它可以算作是帝国海军的预备役，在没有海军基地的地方由内务部代管，但资金由行商浪人们提供，并且在和平时期为商船队提供船员，而一旦附近爆发战争，海军就可以随时随地补充海员。
船员之家的主要招募对象则是中巢和下巢的适龄青少年，一般需要培养4-6年，这也算是一个不错的出路，不过成为船员也往往意味着可能这一生都要告别家乡，很多人在第一次航行后就再也没有返回。
第三，是各种民间教育机构，这又分为许多种类，比如以街区为单位，由平民们自己凑钱出资建立起来的“私塾”，这种学校一般规模都比较小，学生很少超过百人，教师也就那么两三个，主要招收那些6-12岁的儿童，因此与其说是学校，倒不如说是托儿所，这种学校环境很简陋，老师也通常只是稍微懂一点知识的普通人担任，能够教导给学生们的东西很少，极少数能教授高哥特语的老师收费也极贵。
还有就是各类商会，行会以及工业联合体开设的大型学院，由于雄厚的财力，这些商业组织也能够建立起非常完善的教育体系，甚至能从6岁一直教到20岁，其学科项目也同样繁杂，其招收范围主要是企业和组织内部的职员的孩子，还有一些民间聪慧的，能够通过智商检测的孩子，目标就是从小培养对组织高度忠诚的各类员工和研究员，这也是防止竞争对手渗透的一个重要手段，不过这种机构一般也都是设置在中巢和上巢。
另有就是由机械修会开办的技术院，但其招收人数极少，结构过于特殊，更接近成人教育，一般很少做讨论。
第四，则是专属于上巢和顶巢的综合性学府，也就是俗称的贵族学院。
贵族学院按照学生的不同年龄有着详细的划分，5-7岁是幼儿教育，7-11岁是小学教育，11-16岁是中学教育，16-19岁是高等教育，19岁后进入更为专业的子学院，如法院学，军事学院，政治学院，历史学院，艺术学院等，从这些子学院毕业后，他们就会成为预备执法官，当地卫军军官，部门官员，学者等帝国统治的基石。